Ils sont à rechercher, en priorité, au niveau de la sphère racinaire des sujets malingres, moribonds ou morts. Dans ce qui suit vont être développés les cas les plus fréquemment rencontrés lors des expertises visant à comprendre les causes de mauvaise végétation et de mortalité précoce ou tardive.
En premier lieu, il faut retenir la mauvaise qualité des systèmes racinaires des jeunes plants. Bien évidemment, les défauts racinaires résultent de pratiques culturales inadaptées aux espèces élevées souvent dans des contenants ne permettant pas au végétal de développer librement son système racinaire sans rencontrer de contraintes physiques importantes. Les anomalies et déformations diverses induites chez les jeunes plants, lors de leur culture et élevage, se retrouvent chez les sujets adultes et sénescents. En effet, il n’est pas rare de reconnaître des défauts racinaires importants sur de vieux arbres chablis, après une tempête. Les défauts majeurs les plus couramment observés sont :

Les chignons racinaires
Ils résultent de l’incompatibilité des volumes système racinaire/contenant, le volume de ce dernier étant trop faible pour permettre un bon développement racinaire. La tare engendrée est définitive. Certaines espèces, notamment celles qui émettent d’abord un puissant pivot (axe 1 de l’architecture), sont rapidement limitées par les parois de conteneurs trop petits (5, 6, 7). Les chênes, noyers, pins, pour ne citer que quelques exemples, formant très tôt un pivot, sont particulièrement sensibles au « chignonage ». En conséquence, il y a tout intérêt à les élever dans des contenants évitant des malformations racinaires irréversibles, sauf, bien sûr, en pratiquant des tailles à des fins de réformation des racines. Dans ce cas, on en arrive à bouturer des jeunes plants comme le montre le cliché présentant des limites exacerbées (8).

Les spiralisations simples
et multiples
Les spiralisations s’observent dans les cas d’élevage de plants dont le système racinaire est maintenu trop longtemps dans des contenants inadaptés soit par rapport à la vitesse de développement des racines, soit par

rapport aux caractéristiques morphologiques de celles-ci et ce, en fonction de l’espèce. L’enroulement du système racinaire contre la paroi interne du conteneur est souvent exacerbé par les paramètres trophiques et physiques caractérisant ce niveau. Lors de transplantations dans des conteneurs de volumes plus importants et dans la mesure où les racines y séjournent trop longtemps, il est fréquent d’observer plusieurs niveaux de spirales (9). Les mêmes anomalies morphologiques sont observées lors de culture de plants en paniers successifs, lorsque ceux-ci sont conservés intacts ou découpés. Les spiralisations affectent tant les pivots que l’ensemble des autres racines. L’emboîtement des contenants se traduit souvent par une mauvaise végétation des plants une fois mis en terre. Bien souvent, après une longue période de dépérissement, ceux-ci meurent, victimes de strangulations observables à tous les niveaux du système racinaire. Il faut souligner que ces graves altérations s’observent fréquemment chez les végétaux élevés en paniers qui n’ont pas été supprimés lors des transplantations ou lors de la plantation définitive.